maxbin2_checkm_slurm_illumina Slurm工作流程，用于DSMZ中的元基因组合并。此脚本依赖于Slurm调度程序来协调计算机资源。它汇集了几种生物信息学工具，并且在中间增加了重要的一步：过滤引物二聚体（“鲤鱼”序列）。 先决条件 饮 镰刀 梅加希特 Maxbin2 领结2 Samtools MetaBat2 编造 Checkm DAS工具 所有特定于管道的工具都已经安装在DSMZ的“合并”环境中。要使用合并环境。在您的〜/ .condarc中添加以下两行 en

Slurm工作负载管理器 这是Slurm工作负载管理器。 Slurm是一个开放源代码群集资源管理和作业计划系统，力求简单，可扩展，可移植，容错且与互连无关。 Slurm当前仅在Linux下进行了测试。 作为集群资源管理器，Slurm提供了三个关键功能。 首先，它在一段时间内为用户分配对资源（计算节点）的独占和/或非独占访问权限，以便他们可以执行工作。 其次，它提供了一个框架，用于在分配的节点集上启动，执行和监视工作（通常是并行作业）。 最后，它通过管理待处理的工作队列来仲裁冲突的资源请求。 G