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smoothxg:使用封闭的偏序对齐来线性化和简化变异图-源码
光滑的 使用偏序对齐的变异图局部重建 从原始比对组构建的Pangenome图可能具有复杂的局部结构,这些结构是由基因组变异的常见模式生成的。这些局部非线性会给下游分析,可视化和解释变化图带来困难。 smoothxg查找变化图smoothxg线的路径块。它将部分顺序对齐应用于每个块,从而生成一个非循环变化图。然后,要生成“平滑的”图,它将走原始路径将这些子图连接在一起。生成的图形仅包含大于所选块大小的循环或反相结构,否则为线性线性。除了为图提供线性结构外, smoothxg通过对每条链应用最重的
所属分类:
其它
发布日期:2021-03-20
文件大小:187392
提供者:
weixin_42137539