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Data-Visualizations:UCSC CSE 163的数据可视化-源码
数据可视化 UCSC CSE 163的数据可视化 计划6-条形图显示2020年各国的GDP 计划7-折线图,按国家/地区显示能源使用情况 计划8-2010年按国家GDP划分的能源消耗散点图 程序9-D3.js中Voronoi图的示例和教程
所属分类:
其它
发布日期:2021-03-17
文件大小:253952
提供者:
weixin_42110533
r-docker:带基本包装的R-源码
带基本包装的R 已安装的套件 整洁的 xlsx RSQLite的 闪亮的 rmarkdown 针织衫 表格 jsonlite 解构信号 BSgenome.Hsapiens.UCSC.hg19 录像机
所属分类:
其它
发布日期:2021-03-13
文件大小:2048
提供者:
weixin_42134338
horvath-2013-clock-源码
预测年龄:两性之间的DNA甲基化时钟差异 总结步骤: 1运行GEOquery.seq以下载训练和测试数据集的样本。 2运行common_methylation_ids.seq以从所有登录样本中获取通用ID。 3在每个登录名上运行preprocessing.seq以创建训练文件。 4使用包含您的训练文件的文件夹运行elasticnet_train.seq。 5通过运行fast_coef_check.seq检查学习的系数,然后选择适当的精度以选择重要的系数。 6使用check_betas
所属分类:
其它
发布日期:2021-03-10
文件大小:24117248
提供者:
weixin_42118770
ucsc-tracks-for-rat-projection-dataset:大鼠投影数据集-源码
ucsc跟踪大鼠投影数据集 大鼠投影数据集
所属分类:
其它
发布日期:2021-03-06
文件大小:10485760
提供者:
weixin_42138376
汤尔-UL87LTF-源码
汤尔-UL87LTF 这是现有和新的HCMV Towne-UL87LTF数据集的精选集合,可在查看。 用法: First go to the UCSC Genome Browser. Then, navigate to My Data > Track Hubs. Select the My Hubs tab. Finally, paste https://raw.githubusercontent.com/meierjl/Towne-UL87LTF/master/hub.txt int
所属分类:
其它
发布日期:2021-02-28
文件大小:28311552
提供者:
weixin_42175035
基因注释-源码
安装 该存储库仅包含独立脚本。 在运行之前,请确保安装要求: pip install -r requirements.txt 示例1:从UCSC GTF文件 从下载UCSC gtfToGenePred二进制文件 获取程序集的GTF和chromsizes文件( -NP .参数确保如果文件已经存在,则不下载文件) wget -NP . https://hgdownload.soe.ucsc.edu/goldenPath/danRer10/bigZips/genes/danRer10.refGen
所属分类:
其它
发布日期:2021-02-25
文件大小:7168
提供者:
weixin_42133415
肯特:UCSC Genome Browser源代码树。 稳定分支:“测试版”-源码
肯特:UCSC Genome Browser源代码树。 稳定分支:“测试版”
所属分类:
其它
发布日期:2021-02-24
文件大小:141557760
提供者:
weixin_42134054
slugtrades:一个简单的用户-用户交易平台,人们可以在其中交换喜爱但不经常使用的商品,而不必用它们来填埋-源码
弹头贸易 ucsc买/卖/交易网站 快速开始 git克隆 cd slugtrades python3 -m venv env 源环境/ bin /激活 点安装-r slug_trade / requirements.txt cd slug_trade ./manage.py makemigrations ./manage.py迁移 ./manage.py populate_db ./manage.py运行服务器
所属分类:
其它
发布日期:2021-02-23
文件大小:48234496
提供者:
weixin_42134234
克莱特-源码
克莱特 数据源 depmap: ://depmap.org/portal/download/ xena: ://xena.ucsc.edu/public/ gdsc: ://www.cancerrxgene.org/gdsc1000/GDSC1000_WebResources/Home.html CLEIT框架
所属分类:
其它
发布日期:2021-02-22
文件大小:8388608
提供者:
weixin_42113552
孤独而非孤独:UCSC游戏设计程序的顶峰游戏-源码
孤独而不孤单 UCSC游戏设计程序的顶峰游戏
所属分类:
其它
发布日期:2021-02-18
文件大小:787480576
提供者:
weixin_42143806
POP序列-源码
分析POP-seq数据的管道(从比对到峰调用) 图1: K562细胞中POP-seq方案的完整工作流程和数据分析(A)使用trizol裂解细胞以产生三个相(水相,相间和有机相)。 使用RNase A / T1混合物,蛋白酶K和DNase消化来自POP-seq变体的细胞裂解液,然后进行r-RNA消耗,RNA质量检查和文库制备以进行照明测序(B)POP-seq数据处理和下游分析的工作流程。 先决条件 根据用户手册安装以下软件: fastqc( ) Samtools( ) Bedtools
所属分类:
其它
发布日期:2021-02-18
文件大小:970752
提供者:
weixin_42134234
ucsc-源码
ucsc
所属分类:
其它
发布日期:2021-02-17
文件大小:3072
提供者:
weixin_42133861
kelpforest:从http:kelpforest.ucsc.edu生成的物种相互作用数据集-源码
海带森林 从生成的物种相互作用数据集。 Beas-Luna,R.,A。Black,M。Novak,M。Carr,J。Caselle,J。Estes,P。Levin,T。Tinker。 (2014)用于告知生态系统模型的物种相互作用的在线数据库 。 PlosOne PONE-D-14-18906R1 可通过。
所属分类:
其它
发布日期:2021-02-17
文件大小:1024
提供者:
weixin_42099116
CMPM121Final:UCSC CMPM 121:Game Technologies的Barry Day和Maxfield Friedman最终项目-源码
CMPM121最终 Barry Day和Maxfield Friedman的UCSC CMPM 121:游戏技术的最终项目。
所属分类:
其它
发布日期:2021-02-16
文件大小:123731968
提供者:
weixin_42138525
compareBBI:pyBBI和bigWigSummary之间的比较-源码
比较BBI pyBBI和bigWigSummary之间的比较 结果 测试结果 设置 git clone https://github.com/deltarod/compareBBI.git cd compareBBI wget http://hgdownload.soe.ucsc.edu/admin/exe/linux.x86_64.v385/bigWigSummary sudo chmod a+x bigWigSummary python3 -m pip install pybbi
所属分类:
其它
发布日期:2021-02-15
文件大小:22528
提供者:
weixin_42168830
网络应用-源码
这些是我在UCSC的Web Applications(CSE 183) UCSC中所做的项目,由Luca de Alfaro 2020年Spring授课。 最终成绩:A- 技术:py4web,它使用javascr ipt,Bulma CSS和python。 bottle.py是数据库 注意:在本课程中,将使用签名/加密请求,以确保我们的应用程序在一定程度上是安全的。 Bulma CSS项目是一个简单的单页应用程序,旨在让学生熟悉用于本课程的网络技术。 产品清单。 允许用户按各种属性对列表
所属分类:
其它
发布日期:2021-02-13
文件大小:4194304
提供者:
weixin_42133680
webgl-3D-space-project-源码
自从我上交以来,这个项目就已经中断了(可能是由于OpenGL的变化)。 但这基本上是微型Minecraft的克隆,具有多维数据集和可导航的空间。 对于UCSC的计算机图形学 webgl-3D-space-project
所属分类:
其它
发布日期:2021-02-11
文件大小:23552
提供者:
weixin_42132056
出版物:已发表论文中使用的脚本-源码
已发表论文(和UCSC跟踪中心)中使用的脚本
所属分类:
其它
发布日期:2021-02-11
文件大小:10485760
提供者:
weixin_42128015
trackhub-registry:TrackHub注册表的规范和实现-源码
Trackhub注册中心 该存储库包含TrackHub注册表的规范和实现。 TrackHub是一项允许将大规模基因组数据集有效集成到现代基因组浏览器中的技术。 TrackHubs表示一种通过单个可附加URL(统一资源定位符)整理相关数据集以呈现为单个实体的方式。 这些数据集以二进制索引文件格式(例如bigBed,bigWig,BAM,VCF)提供,支持部分下载和缓存,从而大大提高了DAS的性能。 它们可以托管在简单的HTTP或FTP服务器上,从而降低了设置和维护成本。 UCSC和Ensemb
所属分类:
其它
发布日期:2021-02-05
文件大小:103809024
提供者:
weixin_42110070
Alterrain:Node.js中HTML5多人游戏-源码
Alterrain MMO UCSC CMPM 120 Phaser多人游戏 球队 燕文旭( ) - :floppy_disk: 后端开发人员 朱利奥·蔡( )- :laptop: 前端开发人员 :artist_palette: 游戏美术师 大卫·柯克帕特里克( )- :artist_palette: 游戏美术师 :speaker_medium_volume: 游戏音频 链接 服务器 16.04上的Ubuntu NodeJS 10.0 1 GB内存/ 25 GB磁盘/ SFO2
所属分类:
其它
发布日期:2021-02-03
文件大小:3145728
提供者:
weixin_42102933
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