渐进式UMAP 渐进统一流形近似和投影（PUMAP）是的渐进算法，可确保在进行过程中生成其中间输出。 基于渐进式K最近邻居查找表，UMAP中的顺序步骤已转换为支持渐进式。 在合理的时间内，其丢失和嵌入输出可与UMAP媲美。 安装 源代码是在Ubuntu 18.04环境下构建和测试的。 以下说明假定您使用的是Ubuntu 18.04。 下载源代码： git clone https://github.com/hyungkwonko/progressive-umap.git 建立 mkdir

umap：均匀流形逼近和投影

NCI-DOE-Collab-Pilot1-Gene_Expression_Autoencoder 描述： 基因表达自动编码器功能（试点1基准1，也称为P1B1）显示了如何构建稀疏自动编码器，该稀疏自动编码器可以将高维表达谱压缩为低维向量。 用户社区： 研究人员对以下主题感兴趣： 初级：癌症生物学数据建模 中学：机器学习； 生物信息学； 计算生物学 可用性： 当前代码大量使用了CANDLE API。 可由在python和领域中经验丰富的数据科学家使用。 唯一性： 自动编码器不是降低尺寸