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vg:用于处理基因组变异图的工具-源码
vg 变异图数据结构,互换格式,对齐方式,基因分型和变异调用方法 变异图提供了许多基因组序列的简洁编码。 变异图(特别是在vg中实现)由以下部分组成: 节点,由序列和ID标记 边缘,通过两个端点的任意一端连接两个节点 路径,描述通过边缘连接的节点时的基因组,序列比对和注释(例如基因模型和转录本) 该模型类似于已在装配和多序列比对中使用的序列图。 路径提供了相对于图中编码的基因组的坐标系,即使更改了图的结构,也可以生成稳定的映射。 变异图模型使这种嵌入变得明确而必不可少。 vg中的工具在图
所属分类:
其它
发布日期:2021-02-26
文件大小:25165824
提供者:
weixin_42109732