文件名称:
ancient_DNA_salish_sea:手稿的脚本-源码
开发工具:
文件大小: 2mb
下载次数: 0
上传时间: 2021-03-16
详细说明:古代DNA的杂交捕获
该存储库包含手稿“古代DNA的杂交捕获揭示了900年来海岸萨利什(Salish)渔业冬季产卵鲱鱼种群的收获”中使用的脚本。
研究概述
长期以来,不同种群或表型对生态系统产品的贡献程度尚不清楚。 对种群多样性进行时间研究在诸如太平洋鲱鱼等饲料鱼中尤为重要,因为它们是沿海食物网,文化和经济的基础。 在这项研究中,我们使用从华盛顿普吉特海湾伯顿英亩考古遗址出土的鲱鱼骨(N = 44)中提取的古代DNA,研究了近千年来遗传上不同的鲱鱼种群对食物供应的相对贡献。 我们应用杂交捕获技术对古代样本中约5,000个SNP进行基因分型,并确定了沿海岸Salish渔民在约900年的时间里收获的鲱鱼种群。
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