文件名称:
NICU_Microbiome_Study:微生物组分析和相关数据-源码
开发工具:
文件大小: 1mb
下载次数: 0
上传时间: 2021-03-15
详细说明：重症监护病房_微生物组_研究
微生物组分析和相关数据。
此回购包含手稿“表征非常早产儿的细菌肠道微生物组”的补充数据。 这包括：
完整的工作流程，从原始读取到分析。
元数据（已标识）。
元数据摘要。
对于上下文，以下是本研究中使用的方法的摘要。
实验室规程
使用Bioline ISOLATE粪便DNA试剂盒进行DNA提取，并与制造商协商进行修改以优化DNA产量。 这包括增加β-巯基乙醇（从0.5％到1％，以增加DNA溶解度并减少二级结构的形成），增加额外的洗涤步骤（以提高纯度）和减少洗脱缓冲液体积（以增加最终DNA浓度）。
对于文库制备，我们使用Index Kit v2 C和Platinum:trade_mark:SuperFi:trade_mark:PCR Master Mix遵循Illumina宏基因组学文库制备方案。
对于测序，我们将MiSeq试剂盒V3与Illumina MiSeq系统结合使用，以785F /
(系统自动生成,下载前可以参看下载内容)
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