文件名称:
generand:生成FASTAFASTQ,SAM或VCF格式的随机基因组数据-源码
开发工具:
文件大小: 8kb
下载次数: 0
上传时间: 2021-03-15
详细说明:慷慨的
生成FASTA / FASTQ,SAM或VCF格式的随机基因组数据,输出到标准输出。
输出数据是完全随机的,适合于新程序的基本测试和基准测试,或用于学术目的快速生成小样本。
Generand对于动态生成大型测试输入特别有用,因此无需手动生成和/或存储它们。
当前,随机化非常简单,但是将来我们可能会添加参数,以允许针对特定情况生成更实际的数据。
用法
Fasta通用序列,序列长度
fastq序列的序列长度
通用山姆染色体比对-每染色体序列长度
常规vcf染色体每染色体检出率
描述
Generand Fast [aq]序列序列长度
生成“序列”序列的FASTA或FASTQ流,每个序列的长度为“ sequence-length”。 序列含量是随机的,碱基分布均匀,因此GC含量应非常接近50%。
FASTQ流中的PHRED分数以相等分数的块生成,并且大多数都是高质量的。 最后的几个
(系统自动生成,下载前可以参看下载内容)
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