文件名称:
Chlamy-EnPhosSite-源码
开发工具:
文件大小: 1kb
下载次数: 0
上传时间: 2021-03-15
详细说明：Chlamy-EnPhosSite
Chlamy-EnPhosSite：一种基于深度学习的方法，用于莱茵衣藻特异性磷酸化位点的预测。 由Niraj Thapa在KC实验室中开发。
要求
后端= Tensorflow 凯拉斯脾气暴躁的生物蟒斯克莱恩Imblearn
文件提取
使用winrar或任何支持* .rar文件的应用程序进行提取。 从chlamy.part01开始。 将所有文件放在同一文件夹中。
数据集
数据集采用FASTA格式，其中蛋白质窗口大小为57。同时提供了训练和测试数据集。 有两个正例和负例的数据集。
模型
包括两个模型。 基于多窗口的模型（Chlamy-MwPhosSite）和基于整体堆叠的模型（Chlamy-EnPhosSite）。包含格式为* .h5的预训练模型文件。
给定测试数据集的预测
安装所有先决条件后，分别运行-> model_multi.py以运行Chl
(系统自动生成,下载前可以参看下载内容)
下载文件列表
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