开发工具:
文件大小: 6kb
下载次数: 0
上传时间: 2021-03-14
详细说明：6mA范围
描述
6mASCOPE是使用定量反卷积方法评估真核物种中6mA事件的工具箱。 通过在PacBio测序Sequel II系统上使用新颖的短插入文库（200〜600bp）设计，6mASCOPE有效地利用了大量的圆形共识（CCS）读数来可靠地捕获单分子分辨率下IPD值的偏差。 采用创新的宏基因组学方法，6mA SCOPE将来自gDNA样品的DNA分子解卷积为感兴趣的物种和基因组区域以及污染源。 使用合理设计的机器学习模型，6mASCOPE可以对每种反卷积成分进行灵敏而可靠的6mA定量。
使用权
当前版本供稿件审阅。 发布后，我们计划在我们的GitHub页面上公开发布6mASOCPE。
安装
6mASCOPE作为全功能映像分发，无需安装除虚拟化软件以外的任何依赖项。 我们建议使用Singularity，它可以安装在Linux系统上，并且通常是HPC管理员首选的解决方案（）。 6mASC
(系统自动生成,下载前可以参看下载内容)
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