文件名称:
MetaWorks:MetaWorks是一个灵活的多标记元条形码管道，用于处理从原始fastq.gz文件到分类分配的成对末端Illumina读取-源码
开发工具:
文件大小: 243kb
下载次数: 0
上传时间: 2021-03-14
详细说明：MetaWorks的
MetaWorks由一个conda环境和Snakemake流水线组成，这些流水线将在命令行中运行，以生物信息学方式处理从原始读取到分类分配的Illumina配对末端元条形码。 MetaWorks当前支持许多流行的标记基因扩增子和元条形码：COI（真核生物），rbcL（真核生物，硅藻），ITS（真菌，植物），16S（原核生物），18S（真核生物，硅藻），12S（鱼）和28S（真菌）。 使用RDP分类器进行分类分配，该分类器使用朴素的贝叶斯方法来生成分类分配，并在每个等级上提供一定程度的统计支持。
替代数据流：
默认数据流从Illumina的成对末端多路分解的fastq文件开始，并生成分类学分配的精确序列变体（ESV）。
# quickstart default ESV pipeline
snakemake --jobs 24 --snakefile snakefil
(系统自动生成,下载前可以参看下载内容)
下载文件列表
相关说明
- 本站资源为会员上传分享交流与学习,如有侵犯您的权益,请联系我们删除.
- 本站是交换下载平台，提供交流渠道，下载内容来自于网络，除下载问题外，其它问题请自行百度。
- 本站已设置防盗链，请勿用迅雷、QQ旋风等多线程下载软件下载资源，下载后用WinRAR最新版进行解压.
- 如果您发现内容无法下载，请稍后再次尝试；或者到消费记录里找到下载记录反馈给我们.
- 下载后发现下载的内容跟说明不相乎，请到消费记录里找到下载记录反馈给我们，经确认后退回积分.
- 如下载前有疑问，可以通过点击"提供者"的名字，查看对方的联系方式，联系对方咨询.
