文件名称:
NWAlignment:Needleman-Wunsch比对工具,用于成对序列比对-源码
开发工具:
文件大小: 19kb
下载次数: 0
上传时间: 2021-03-14
详细说明:#NWAlignment
该工具旨在根据执行成对序列比对。 当前程序版本使用简单的评分系统,其中差距和不匹配得分为-1,匹配定义为+1。
###要求:
> =版本3.10
C ++ 20标准
编译:
导航到“代码”目录cd Code
创建一个名为“ build”的文件夹mkdir build
导航到新生成的文件夹cd build
使用cmake编译项目cmake ..
生成可执行文件make
运行程序,如下所示
###用法:允许的参数:
短的
长
类型
描述
-一世
- 输入
细绳
输入的seuqnece文件的路径(FASTA格式,结尾为.fa或.fasta
-o
- 输出
细绳
输出文件的路径(任何文件格式)
-H
- 帮助
--
显示一些帮助性文字和使用信息
笔记:
要执行对齐,必须定义输入和输出文件
帮助请求被视为单个参数
示例运行: 进行对
(系统自动生成,下载前可以参看下载内容)
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