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文件大小: 24mb
下载次数: 0
上传时间: 2021-03-13
详细说明：scGen
介绍
scGen的PyTorch实现。 scGen是一种生成模型，可预测跨细胞类型，研究和物种的单细胞扰动React 。
尝试
创建VAEArith模型并在示例数据集上对其进行训练。
import scanpy as sc
import torch
import scgen_torch as scg
## data
train_data = sc.read("./scgen_torch/data/train_data.h5ad") # Read and load the training dataset (AnnData object)
## create vaeArith model and train it
vaearith = scg.model.VAEARITH(adata = train_data)
vaearith.train()
(系统自动生成,下载前可以参看下载内容)
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