文件名称:
cute-nucleotides:Rust中SIMD向量化核苷酸的二进制编码和解码的可爱技巧-源码
开发工具:
文件大小: 20kb
下载次数: 0
上传时间: 2021-03-13
详细说明：可爱的核苷酸 :dna: :laptop:
Rust中SIMD向量化核苷酸的二进制编码和解码的可爱技巧。
跑步
要运行测试，请使用带有特殊标志的货物，告知其以您的CPU为目标，以实现最高效率。
RUSTFLAGS="-C target-cpu=native" cargo test
您还可以运行基准测试：
RUSTFLAGS="-C target-cpu=native" cargo bench
这些都应在支持AVX2和BMI2指令的x86 CPU（因此，现代的Intel和AMD CPU）上运行。 请注意，许多功能不是以跨平台方式编写的。
警告：有很多不安全的代码！ 您的眼睛可能会欺骗您，使您以为代码是用C编写的。不，（不幸的是）它是100％的有机Rust。 阅读它需要您自担风险。
还有就是要组织一些这里的代码到库（目前尚未完成的）企图。 也有寻找核苷酸互补SIMD加速实现，计算汉明距离，并检查是否一个
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