文件名称:
transcriptomic_snakes:蛇形管道的演示-源码
开发工具:
文件大小: 114mb
下载次数: 0
上传时间: 2021-03-12
详细说明：transcriptomic_snakes
蛇形管道的演示
设置conda：
设置snakemake：
克隆此git，确保$ PATH中有可用的snakemake并运行：
snakemake --cores 8 --use-conda
从./transcriptomic_snakes/内部，第一次运行需要更长的时间，因为需要设置R。
当满足所有要求后，替换1_Reads目录中的单端读取基因组.fna和genes.gff，运行
sh cleanup.sh
接着：
snakemake --cores 8 --use-conda
该管道要求您在具有conda和snakemake设置Linux环境中，没有其他要求。
运行管道后，所有结果都可在5_Results /目录中找到。
(系统自动生成,下载前可以参看下载内容)
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