开发工具:
文件大小: 21kb
下载次数: 0
上传时间: 2021-03-12
详细说明：ecc_workflow
该分析采用皮埃尔·茹贝尔的工具，修改后的版本调用eccDNAs在稻栽培的小圆圈-seq的实验。 Nipponbare。
未经处理的植物（标记为RC，3个生物代表） 每个生物学代表3个技术代表
受感染的植物（标记为IF，3个生物学代表） 每个生物学代表3个技术代表
准备数据
首先，您需要将所有fastq.gz文件移动到raw_data/ 。
bin/units.tsv解释了所需文件的名称和条件。
欢迎您与其他示例一起运行此工作流程，但是您需要编辑bin/units.tsv以匹配您的inpt数据。
如果要更改分析中使用的组蛋白标记数据集，则需要在Snakefile重新编写必要的规则，因为当前已对该部分进行了硬编码，以确保此分析的可重复性。
设定Snakemake
该项目旨在将克隆萨维奥，加州大学伯克利分校HPC，并使用通过jobscripts通过自动写入S
(系统自动生成,下载前可以参看下载内容)
下载文件列表
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