文件名称:
Protein-Lifetime-Project:此python脚本允许用户遵循N端规则获得细胞中蛋白质的寿命，通过该规则，蛋白质半衰期由蛋白质序列中的最后一个氨基酸计算得出-源码
开发工具:
文件大小: 2kb
下载次数: 0
上传时间: 2021-03-12
详细说明：蛋白质终身计划
该python脚本允许用户遵循N端规则获得细胞中蛋白质的寿命，通过该规则，蛋白质半衰期是由蛋白质序列中的最后一个氨基酸计算出来的。
背景
90年代，亚历山大·瓦尔沙夫斯基（Alexander Varshavsky）和他的团队首先描述了N端规则。 它将蛋白质的体内半衰期与其N末端残基的身份联系起来。 他得出的结论是，N-末端规则的相似但截然不同的版本适用于所有生物，从哺乳动物到真菌再到细菌。 因此，据此，应该有可能从蛋白质序列计算蛋白质的半衰期，并使用生物信息学方法估算蛋白质在细胞中的寿命。
代码
该代码是使用Spyder版本4.2.3（是Python开发环境）使用Python3版本3.8开发的。 可以使用跨平台的Anaconda发行版下载Spyder。
Python模块
在使用此脚本之前，建议使用Anaconda Prompt安装以下Python模块：
PySimpleG
(系统自动生成,下载前可以参看下载内容)
下载文件列表
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