文件名称:
AlignGraph2:类似基因组辅助的重组流程，适用于PacBio的长读-源码
开发工具:
文件大小: 7mb
下载次数: 0
上传时间: 2021-03-12
详细说明：介绍
AlignGraph2是用于PacBio长读取的的第二个版本。 它利用与测序基因组相似的已公开基因组，扩展和完善了从长时间阅读中组装而成的重叠群。
要求
Linux OS 64位
GCC> = 4.8.5
CMake的> = 3.1.0
使用Biopython的Python> = 3.6
安装
git clone --recursive https://github.com/Godotcoffee/AlignGraph2.git
cd AlignGraph2 && python ./install.py
用法
快速开始
python ./AlignGraph2.py -r /path/to/read -c /path/to/contig -g /path/to/genome -o /path/to/output
强制的
-r, --read [fastq] read -r, --
(系统自动生成,下载前可以参看下载内容)
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