文件名称:
clinical-grade-computational-pathology-using-weakly-supervised-deep-learning-on-whole-slide-images:首个临床等级的AI系统可用源码-源码
开发工具:
文件大小: 985kb
下载次数: 0
上传时间: 2021-03-11
详细说明:全球首个临床级病理AI系统原始码及复现。
介绍:
官方Github : :
个人补充部分
数据集下载。自己申请的,可直接使用, 50G左右。下载,密码: i8fv
数据集准备。官方接口需要指定格式,参考code/README.md 。这里我自己写了一个脚本,见code/dataPrepare_for_CNN.py和code/dataPrepare_for_Rnn.py ,改一下相关路径就好。
训练及测试。将官方代码改成单机数据并行训练,加速训练,单GPU也无需更改代码。具体运行命令,参考code/README.md
具体代码运行流程
运行: code/dataPrepare_for_CNN.py ,生成MIL所需的数据
运行code/MIL_train.py和code/MIL_test.py (很慢)
运行: code/dataPrepare_for_Rnn.py ,生成RNN所需的数据
(系统自动生成,下载前可以参看下载内容)
下载文件列表
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