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上传时间: 2021-03-11
详细说明:在完整基因组序列快速增长的推动下,人们普遍认为基因组注释已主要采用自动方法。 对于细菌和古细菌基因组的计算注释,对翻译起始位点(TIS)的准确预测对于定位基因的蛋白质编码区至关重要。 因此,TIS预测已成为许多基因发现者和TIS加工者的挑战,导致对原核基因组注释中TIS预测或校正以及翻译起始机制的最新研究。 现在是时候让研究界回顾一下原核基因TIS的可用数学模型,以及在基因发现器中用于一系列当前TIS处理器和TIS预测模块的所得算法。 实际上,TIS模型与翻译起始机制的知识一起得到了改进。 总结了对原核基因组翻译起始机制的一些研究。 本文使用了一些已广泛用于TIS识别评估的已公开数据集,对现有方法的性能进行了评估和讨论。 讨论算法与对原核翻译起始机制的理解之间的关系也很有趣,这可以启发我们对细菌和古细菌基因组中TIS预测的最新研究。
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