文件名称:
S3V2_IDEAS_ESMP:S3norm ver2 + IDEAS表观状态主峰列表-源码
开发工具:
文件大小: 101mb
下载次数: 0
上传时间: 2021-03-11
详细说明：S3V2_IDEAS_ESMP：用于对不同细胞类型的表观基因组数据进行规范化，去噪和整合的软件包
S3V2-IDEAS软件包首先通过S3V2对平均读取计数进行归一化，然后使用IDEAS进行基因组分割或在多个数据集中调用主峰列表。 该软件包将bigWig文件用作输入。
图1. S3V2-IDEAS软件包的概述。 S3V2-IDEAS软件包中有两个主要步骤：（A）通过S3V2进行数据归一化和去噪步骤，以及（B和C）通过IDEAS进行数据集成步骤。 数据集成步骤有两种模式。 （B）在表观遗传状态模式下，可以将多个表观遗传特征整合到表观遗传状态模型（D）中。 （C）在信号强度状态模式下，一种表观遗传特征的信号可以聚类为不同的信号强度状态（E）。 （F）可以从多种细胞类型的信号强度状态轨迹中提取其他主峰列表。
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