文件名称:
sc-compReg:R封装用于单细胞比较法规分析-源码
开发工具:
文件大小: 136mb
下载次数: 0
上传时间: 2021-03-11
详细说明:scCompReg
scCompReg(šingle-有丝Çomparativeřegulatory分析)是提供耦合scRNA-SEQ和scATAC-SEQ的聚类和关节嵌入在一个样品上的R包,和两个条件之间进行比较的基因调控分析。
请通过?function (例如?sc_compreg )检查手册页,以获取有关输入和输出类型的详细说明。
系统要求
R(> = 3.6.0)
Bedtools(Linux)
荷马(Linux)
变更记录
v1.0.0
scCompReg第一版。
安装
使用以下命令从源代码安装scCompReg R软件包:
require( devtools )
devtools :: install_github( " SUwonglab/sc-compReg " )
例子
有关使用scCompReg方法的完整示例,请参考example.R 。 必要的数据已上载到
(系统自动生成,下载前可以参看下载内容)
下载文件列表
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