文件名称:
bioinformatics-general_commands:一线命令,用于生物信息学任务-源码
开发工具:
文件大小: 3kb
下载次数: 0
上传时间: 2021-03-10
详细说明:生物信息学中的命令行实用程序
自从论文实习开始以来,我发现并应用了几种不同的命令,以便完成生物信息学中的某些任务。 现在,我是一名博士研究生,但我仍在学习一些执行生物信息学任务的新奇方法。 这是我一直在使用的一些命令。 该页面不断更新。 我还在NGS分析中添加了一些常用的命令配置。
作业系统
所有这些命令都在Linux机器(主要是Ubuntu和CentOS)上执行。
重击
显示第2行的文本文件。
tail --lines=+2
按数字对列2进行排序。
sort -n -k2
打印最后N行。
tail -n N # or tail -N
从文件列表中检查目录中文件的存在。
while IFS= read -r f ; do if [[ -e path/ $f ]] ; then printf ' %s exists in %s\n ' " $f " " path/ " ;
(系统自动生成,下载前可以参看下载内容)
下载文件列表
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