文件名称:
fastqcs3:CHEM E 545546最终项目的主要回购-源码
开发工具:
文件大小: 624kb
下载次数: 0
上传时间: 2021-03-10
详细说明:FastQCS3:16S基因测序的快速定量检查
CHEM E 545/546最终项目的主要回购
概述/目的
该软件的目的是为用户提供一种工具,可在测序结果可用后立即快速运行质量检查。 该软件将设计为可从命令行运行的python可安装软件包。 通过模块化设计,用户将有机会指定他们要执行哪种FastQCS3。
安装依赖项
该软件包依赖于先前发布的微生物组分析软件包来预处理输入数据并提供测序质量指标。 FastQCS3寻求利用QIIME2数据处理功能,同时着重于构建一个交互式仪表板,该仪表板具有比QIIME2的.qza格式更有用的可视化工具。 为了能够使用FastQCS3,必须首先安装QIIME2。
安装Miniconda
您可以按照的说明安装Miniconda。
更新迷你conda
conda update conda
安装wget
conda install wget
如果conda
(系统自动生成,下载前可以参看下载内容)
下载文件列表
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