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文件大小: 20mb
下载次数: 0
上传时间: 2021-03-10
详细说明:访问用于CONSULT基准测试的数据
该存储库包含摘要数据表和我们用来处理它们的脚本。
受控距离
包含针对每个CONSULT,Kraken-II,CLARK,CLARK-S和Bowtie的每个bin计算的召回和误报信息。 它是的输入,以生成图2a中所示的曲线。
包含用于工具性能比较的CONSULT,Kraken-II,CLARK,CLARK-S和Bowtie的运行时间和内存数据。 该表用作的输入,以生成图2b中所示的条形图。
新型基因组
包含针对默认数据库(针对GTken,TOL和Kraken和CONSULT工具的Bac / Arch Kraken数据库)使用默认参数搜索的每个GORG样本的匹配读取百分比。 它是在图3a上生成ECDF曲线的输入。
, 和保持在变量设置下针对GTDB,TOL,Bac / Arch Kraken数据库查询的GORG数据集的平均召回率和假阳性值。 这些
(系统自动生成,下载前可以参看下载内容)
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