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细胞内蛋白质稳定性与溶剂可及氨基酸的特定特征之间的关系
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文件大小: 702kb
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上传时间: 2021-03-09
详细说明：蛋白质降解对于大多数细胞过程至关重要，包括细胞周期进程，信号转导和分化。 深入研究蛋白质序列和结构中的降解信号有助于基于高通量数据集分析蛋白质稳定性。 与其他蛋白质功能相似，暴露于溶剂表面的关键残基和蛋白质表面的局部特定结构（例如裂口和口袋）可能在蛋白质降解中起关键作用。 在本文中，我们基于蛋白质溶剂可及表面的序列和结构特征，深入研究了影响蛋白质降解的内在因素。 结果表明，与长寿蛋白相比，短寿蛋白表面存在更多的疏水残基。 二级结构如线圈倾向于在短寿命蛋白质的表面上。 寿命短的蛋白质表面上有更多的丝氨酸磷酸化位点。 与长寿蛋白相比，短寿蛋白通过PEST基序信号开始降解的可能性更高。 我们还发现，蛋白质数据集中几乎所有N末端残基都暴露在表面上。 因此，溶剂可及表面残基的特定特征是影响细胞内蛋白质稳定性的关键因素。
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