文件名称:
基于miRNA靶标双链体特征预测miRNA介导的基因沉默模式
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文件大小: 398kb
下载次数: 0
上传时间: 2021-03-09
详细说明:miRNA介导的基因沉默有两种主要机制:mRNA降解或翻译抑制。 然而,由miRNA调控的靶mRNA的确切机制仍不清楚。 作为实验的补充方法,提出了一种计算方法来识别miRNA介导的人类基因沉默机制。 我们已经分析了与miRNA介导的mRNA沉默机制相关的广泛特征。 发现双链体结构,结合位点的数目和靶位点区域的结构可及性是确定靶mRNA是被切割还是仅被翻译抑制的有效因素。 基于这些信息特征,构建了基于SVM的分类器来预测miRNA的调控模式。 结果表明,所提出的方法在区分人中靶mRNA是被切割还是被翻译抑制方面是有效的。 此外,已经开发了Web服务器microDoR(http://reprod.njmu.edu.cn/microdor),可供用户免费使用。
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