文件名称:
DRsims:在水中无鱼的情况下运行生态进化模拟的代码-源码
开发工具:
文件大小: 37mb
下载次数: 0
上传时间: 2021-03-09
详细说明：模拟人生
运行本文的生态进化模拟的代码：
Attard等。 （预备中）鱼出水：沙漠中彩虹鱼种群的生态进化动态。
要运行模拟：
在下载仓库
顶层目录DRsimulations /包含Shell脚本，用于运行每个模拟模型的副本， bin /包含用于运行SLiM，处理数据和生成图形的函数和脚本
cd到DRsimulations /
gunzip bin/100K_burnin_state.slim.gz
然后只需运行：
./run_NeXXX_SXX_MXX_CXXX.sh
将run_NeXXX_SXX_MXX_CXXX.sh替换为要运行的仿真模型。
代码很丑 :knocked-out_face: 但它可以工作（在MacOS上测试）。 您将需要确保已安装R，perl，SLiM和vcftools。 我认为它也可以在大多数Linux发行版上使用，但是您需要在bin / process_SLiM_vcf.sh中将gcspli
(系统自动生成,下载前可以参看下载内容)
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