开发工具:
文件大小: 1023kb
下载次数: 0
上传时间: 2021-03-09
详细说明：用于在“基于蛋白质结构的基因表达特征”中生成图形的代码
Rahman，R等。 2021年，PNAS
指示
要从文章中生成图，您可以在交互式R会话期间运行在每个目录中找到的脚本，其中脚本的每一行都发送到R终端。
每个图形的每个脚本都是独立的，可以单独运行。 但是，所有脚本都需要填充图形目录中的数据目录。
此存储库中包含一些实用程序脚本，用于解析GTEx数据或在R中创建和训练自动编码器。
该代码已经过验证，可以在以下平台上运行：Ubuntu 20.04 LTS，Ubuntu 18.04 LTS和适用于Linux的Windows子系统。 您的里程可能因其他平台而异。
资料目录
所有代码都引用了figures/data/目录这是一个目录，其中包含用于生成图形的数据。
由于所生成数据的大小（> 4GB），该存储库中未包含该数据，但可以从此处下载： :
请解压缩文件，然后将文件夹放置到f
(系统自动生成,下载前可以参看下载内容)
下载文件列表
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