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文件名称: 使用Graphlet相互作用预测潜在的小分子相关MicroRNA。
  所属分类: 其它
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  上传时间: 2021-03-09
  提 供 者: weixin_********
 详细说明:微小分子(miRNA)最近被小分子靶向,用小分子靶向miRNA成为人类疾病的一种可能的治疗方法。 因此,研究小分子与miRNA之间的关系是非常有意义的。 本文结合小分子相似性网络,miRNA相似性网络和已知的小分子miRNA关联网络,提出了一种基于Graphlet交互作用的预测模型,用于小分子-miRNA关联预测(GISMMA)。 该模型使用由28个异构体组成的小图相互作用描述了两个小分子之间或两个miRNA之间的复杂关系。 基于分别计数整个小分子相似性网络和miRNA相似性网络中的小图相互作用的数量,计算小分子与miRNA之间的关联评分。 在两个数据集中实施了全局和两种类型的局部留一法交叉验证(LOOCV)以及五重交叉验证,以评估GISMMA。 对于数据集1 ,,全局LOOCV的AUC为0.9291,两个本地LOOCV的AUC为0.9505,五重交叉验证的AUC为0.9263 0.0026; 对于数据集2,AUC依次为0.8203,.0.8640、0.6591和0.8554 0.0063。 在对小分子5-氟尿嘧啶,17b-雌二醇和5-Aza-20-脱氧胞苷的案例研究中,由GISMMA
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