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用于识别受突变影响的蛋白质间相互作用的文献分类：一种神经网络集成方法
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上传时间: 2021-03-08
详细说明：精准医学（PM）计划承诺根据患者的遗传特征及其相关React来确定个性化治疗方法。 为了帮助卫生专业人员和研究人员开展PM工作，BioCreative VI组织了一次PM Track，以挖掘受生物医学文献中基因突变影响的蛋白质-蛋白质相互作用（PPI）。 在本文中，我们提出了一种神经网络集成方法来识别描述受突变影响的PPI的相关文章。 在这种方法中，几个神经网络模型用于文档分类，并且集合的性能优于任何单个模型。 在正式运行中，我们最好的提交在BioCreative VI PM文件分类任务中的F得分达到69.04％。 经过挑战后分析，为解决训练集规模有限的问题，我们将PPI预训练模块纳入我们的方法中，以进一步提高性能。 最后，我们最好的集成方法在测试集上达到71.04％的F分数。
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