文件名称:
生物医学文献中的一种蛋白质-蛋白质相互作用的三重杂交提取方法
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上传时间: 2021-03-08
详细说明:蛋白质-蛋白质相互作用提取研究可广泛应用于生命科学研究领域。 但是,大多数基于机器学习的方法都专注于二进制PPI关系提取,这会丢失对PPI研究至关重要的丰富的关系类型信息。 基于规则的开放信息提取方法可以提取PPI三元组(即“蛋白质1,相互作用词,蛋白质2”),但存在召回率低的问题。 在本文中,我们提出了一种混合蛋白-蛋白相互作用的三重提取方法。 在这种方法中,首先,机器学习技术用于识别蛋白质实体并提取相关的蛋白质对。 然后,使用句法模式和字典来找出代表两个蛋白质之间关系的对应交互词。 该方法在AImed语料库上获得40.18%的F分数,这比基于规则的斯坦福公开信息提取方法所获得的结果要高得多。
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