文件名称:
基于Deepwalk的网络拓扑相似度预测与表位相关的TCR
开发工具:
文件大小: 2mb
下载次数: 0
上传时间: 2021-03-08
详细说明：摘要当前，在线上有许多工具可用于T细胞表位预测。 他们通常专注于肽与抗原呈递细胞（APC）表面上的主要组织相容性复合体（MHC）分子的结合。 但是，肽和MHC复合物与T细胞受体（TCR）的结合对于免疫过程也很关键。 鉴定人表位与TCR的结合将对开发疫苗有用。 它还在诸如癌症和自身免疫性疾病等医学问题上具有广阔的前景。 我们提出了一种基于相似性的基于相似性的TCR表位预测方法。 本文介绍了Deepwalk方法，用于计算TCR-TCR之间的拓扑相似性，构建TCR相似性网络拓扑，并基于已知的TCR-表位关联预测TCR与表位之间的相关性。 我们从VDJDB数据库和经过训练的模型中从22种表位中选择数据，以实现TCR表位预测。 我们根据来自22种类型的表位的数据训练了一个模型，预测每个TCR属于哪个表位。 为了与其他方法进行比较，我们还生成了第二种方法，该方法包括为每种类型的表位训练模型，以便我们可以从大量的TCR中预测哪个TCR与表位结合。 我们使用ROC曲线，PR曲线和其他评估指标对我们的模型进行10倍交叉验证。 在第一个模型中，我们方法的AUC值为0.926，支持向量机（SVM）方法的AU
(系统自动生成,下载前可以参看下载内容)
下载文件列表
相关说明
- 本站资源为会员上传分享交流与学习,如有侵犯您的权益,请联系我们删除.
- 本站是交换下载平台，提供交流渠道，下载内容来自于网络，除下载问题外，其它问题请自行百度。
- 本站已设置防盗链，请勿用迅雷、QQ旋风等多线程下载软件下载资源，下载后用WinRAR最新版进行解压.
- 如果您发现内容无法下载，请稍后再次尝试；或者到消费记录里找到下载记录反馈给我们.
- 下载后发现下载的内容跟说明不相乎，请到消费记录里找到下载记录反馈给我们，经确认后退回积分.
- 如下载前有疑问，可以通过点击"提供者"的名字，查看对方的联系方式，联系对方咨询.
