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twiner:Twiner是基于网络的正则化参数，基于两个数据集之间的相关性模式。 在目前的情况下，它被用来促进对与DNA微阵列和RNA测序表达值数据相关的特征的选择。 两个平台中的基因之间的相关性越高，与之相关的惩罚项越低-源码
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下载次数: 0
上传时间: 2021-03-08
详细说明：缠绕
Twiner是基于网络的正则化参数，基于两个数据集之间的相关性模式。 在本研究中，它被用来促进与DNA微阵列和RNA测序表达值数据相关的特征的选择。 两个平台中的基因之间的相关性越高，与其相关的惩罚项越低。
Twiner代码文件包含：
用于GEO研究的微阵列数据采集
微阵列预处理步骤-分位数归一化
用于微阵列研究的数据集成-ComBat用于批次校正
用于TCGA研究的RNA测序数据采集
RNA测序跨平台与微阵列整合-分位数归一化
带有稀疏逻辑回归的分类模型：6.1。 弹性净罚分6.2。 Twiner-Twin Networks Recovery-我们开发的基于网络的正则化
癌症生物标志物的鉴定
图片：8.1。 PCA分析8.2。 方块图8.3。 小提琴情节8.4。 图生物网络表示8.5。 生存分析图8.6。 维恩图
整合代码包含开发用于识别蛋白质编码基因的代码
(系统自动生成,下载前可以参看下载内容)
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