开发工具:
文件大小: 23kb
下载次数: 0
上传时间: 2021-03-07
详细说明：HoGTIE（水平基因转移识别引擎）
最初被认为仅广泛存在于原核生物中，最近的研究表明整个生命树中普遍存在水平基因转移（HGT）。 HoGTIE结合了基于k-mer的系统发育比较和系统发育比较，以鉴定受体物种中含有HGT的基因组区域和序列。
开发中
HoGTIE正在积极开发中。 如果您想签出代码或对代码有所贡献，可以通过以下方式在本地安装hogtie：
# coming soon...
# conda install hogtie -c conda-forge -c bioconda
# for now, do dev installation with pip
git clone https://github.com/cohen-r/hogtie
cd hogtie
pip install -e .
(系统自动生成,下载前可以参看下载内容)
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