文件名称:
nim-dna-seq:Nim软件包，用于处理核苷酸序列数据-源码
开发工具:
文件大小: 9kb
下载次数: 0
上传时间: 2021-03-07
详细说明：bio_seq
一个用于将核苷酸编码为IUPAC模糊度代码以及写入和读取FASTA文件的库。
基于的核苷酸的8位无符号整数表示形式
对齐解析
对于解析对齐，要求所有FASTA条目都具有相同的长度，否则将引发错误。
解析对齐字符串
import bio_seq
let s = ">header1 \n ACTG \n >header2 \n >CTUG"
let r = parseFastaAlignmentString (s)
解析对齐文件
import nim_seq
let f = parseFastaAlignmentFile ( "file.fasta" )
目前尚不支持写入FASTA文件，但将在接下来的几周内添加
核苷酸转化
将字符转换为核苷酸
import nim_seq
let nuc = 'A' . toNucleotide
也可以创建具有类型构造器的核苷酸，但是不建
(系统自动生成,下载前可以参看下载内容)
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