文件名称:
ElM2D:高性能映射类,可从大型无机成分数据集中构建ElM2D图-源码
开发工具:
文件大小: 38kb
下载次数: 0
上传时间: 2021-03-07
详细说明:ElM2D
高性能映射类,用于从大型离子组成数据集中构造,适用于HPC系统上的单节点使用。 这包括将这些数据集直接嵌入化学空间图的辅助方法,以及对成分列表进行排序和导出内核矩阵的方法。
建议使用python 3.7通过pip安装。
pip install python==3.7
pip install ElM2D
对于背景理论,请阅读我们的论文
例子
来自嵌入PCA的无机晶体结构数据库的125,000种成分,并使用绘制:
有关更多交互示例,请访问
用法
计算距离矩阵
可以通过dm属性访问计算出的距离矩阵,并且可以将其保存并加载为csv文件。
from ElM2D import ElM2D
mapper = ElM2D ()
mapper . fit ( df [ "formula" ])
print ( mapper . dm )
mapper . export_dm ( "C
(系统自动生成,下载前可以参看下载内容)
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