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通过局部因果关联规则发现识别基因突变之间的因果关系
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文件大小: 672kb
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上传时间: 2021-03-07
详细说明:检测基因突变之间的相互作用仍然是遗传学研究中的一个悬而未决的问题。 在各种类型的相互作用中,基因突变之间的因果关系提供了对基因突变和进化的深入了解,是当前研究的重点。 与全局因果网络重构方法不同,我们通过在关联规则发现框架下探索因果概念,提出了一种局部因果发现方法。 首先,我们提出了一种V结构量度(VSM)来评估局部SNP结构的因果意义。 其次,我们开发了一种称为非对称因果关联规则发现(ASCARD)的方法,以考虑候选结构之间的冲突来挖掘可靠的因果关联规则。 最后,对综合数据和WTCCC(Wellcome信任案例控制协会)SNPs数据集进行的实验证明了该方法的有效性。 一些有趣的生物学发现也显示了现实世界中应用的潜力。
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