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文件大小: 76kb
下载次数: 0
上传时间: 2021-03-07
详细说明：聚类
这是一个可选步骤。 如果数据集包含具有不同亚硫酸氢盐可及斑块的序列，则使用“ clustering.py”将整个数据集分为多个组。
在示例文件夹中，“ dsid_C_1461.csv”是需要聚类的数据集。 它的第一列是每个序列的ID，最后一列是每个序列的频率。
“ clustering.py”需要两个参数。
在第1行中，输入文件的路径和名称：〜/ dsid_C_1461.csv
在第2行中，输入集群号。
它为同一文件夹中的群集输出多个csv文件。
贝叶斯分割
“ bayesian_segment.py”用于检测亚硫酸氢盐可及区域。
在示例文件夹中，“ dsid_C_1461_0.csv”是“ clustering.py”输出的群集之一。
“ bayesian_segment.py”仅需要一个参数，即第1行中数据集的路径和名称：〜/ dsid_C_1461_0.csv
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