文件名称:
bacannot:用于原核基因组注释的通用管道-源码
开发工具:
文件大小: 1mb
下载次数: 0
上传时间: 2021-03-07
详细说明:细菌注释(bacannot)管道
Bacannot是易于使用的基于docker的nextflow管道,该管道采用最新软件进行原核基因组注释。 它是围绕几种工具的包装,使您可以更好地了解原核基因组。 它用:
用于通用注释
rRNA预测的
用于在多基因座序列类型(ST)中进行分类的
for KO批注
用于绘制KO注释
用于甲基化注释
用于基因组浏览器生产
的注释合并
用于绘制基因组岛
用于抗菌基因注释的 , , 和
数据库, 和用于序列和基因预测
用于基因组岛预测
用于计算机质粒检测的和
数据库,用于注释整合和共轭元素
和用于注释毒力基因
进一步阅读和补充分析
为了使管道更健壮和更全面,正在开发一个名为的工具包。 它是使用此管道的结果进行比较基因组分析的工具包。 它仍然是一个新事物,但是还不完整,但是仍在不断发展中。 该工具包可能会根据社区需求而增长。
此外,该管道还有两个互补
(系统自动生成,下载前可以参看下载内容)
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