文件名称:
基于Spark的BLAST算法并行化设计与实现。
开发工具:
文件大小: 732kb
下载次数: 0
上传时间: 2021-03-06
详细说明：BLAST（基本局部比对搜索工具）是一种局部比对算法，具有很高的准确度，被广泛使用。 它可以在保持高精度的同时减少程序的运行时间，但是在比较大型基因数据集时却存在性能瓶颈和低效率。 因此，提出了一种基于Spark的分布式并行方法Spark_BLAST。 该方法利用Spark内存计算来识别和划分任务，并实现了BLAST算法的分布式并行计算。 最后，该方法在5个节点的Spark集群上实现。 与单机比较表明，Spark .cluster的加速可以达到约4，而不会改变比较结果的准确性。 该方法为生物信息学提供了一种有效的比对方法。
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