文件名称:
PPI-network-analysis-源码
开发工具:
文件大小: 57kb
下载次数: 0
上传时间: 2021-03-06
详细说明:基于Louvain社区检测算法的聚类蛋白质-蛋白质相互作用(PPI)网络。
该存储库包含使用的python脚本-
从PPI网络中检测具有统计意义的重要社区。
进行集中度分析
要求
python 3.0
网络X 2.4
qstest 1.1.0
熊猫1.0.4
用法
在终端/外壳上:
对于重要的社区检测:
python python / find__significant_module.py -n example / example_network.txt -g example / example_input.txt -o output_directory
有关更多选项:
python python/find__significant_module.py -h
对于中心性分析:
python python/perform_centrality_analysis.py -n
(系统自动生成,下载前可以参看下载内容)
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