文件名称:
amfinder:AMFinder套件包含Python脚本，该脚本可从墨迹斑斑的植物根部图片中对菌根结构进行高通量注释，以及用于手动管理和生成热图的功能齐全的浏览器-源码
开发工具:
文件大小: 123mb
下载次数: 0
上传时间: 2021-03-06
详细说明：AMFinder
自动菌根查找器（AMFinder）可以使用卷积神经网络基于计算机视觉自动识别和量化墨水染色的根图像上的AM真菌定植和自由基内菌丝结构。
概括
命令行脚本（ amf ）
安装说明
amf至少需要Python 3.6 。 以下是使用虚拟环境安装依赖项的典型安装：
$ python3.7 -m venv amfenv
$ source amfenv/bin/activate
(amfenv) $ python -m pip install -r requirements.txt
(amfenv) $ deactivate
注意：由于 amf与最新的Keras / Tensorflow版本不兼容。
预测模式
预测植物根图像中的真菌定植或自由基内菌丝结构。
$ amf predict
可用的列出
(系统自动生成,下载前可以参看下载内容)
下载文件列表
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