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ZIPPCAlnm:具有逻辑正态多项式分布（ZIPPCA-LNM）的零膨胀概率PCA框架将概率PCA从高斯环境扩展到多元丰度数据，并提出了经验贝叶斯方法来推断微生物组成。 已经开发了一种有效的VA算法（分类VA）来拟合该模型-源码
开发工具:
文件大小: 10kb
下载次数: 0
上传时间: 2021-03-05
详细说明：ZIPPCAlnm
具有逻辑正态多项式分布（ZIPPCA-LNM）的零膨胀概率PCA框架
安装
install.packages( " devtools " )
devtools :: install_github( " YanyZeng/ZIPPCAlnm " )
library( ZIPPCAlnm )
描述
具有逻辑正态多项式分布（ZIPPCA-LNM）的零膨胀概率PCA框架将概率PCA从高斯环境扩展到多元丰度数据，并提出了经验贝叶斯方法来推断微生物组成。 已经开发了一种有效的VA算法（分类VA）来拟合该模型。
用法
ZIPPCAlnm( X , V = NULL , n.factors = 2 , rank = FALSE , trace = FALSE , maxit = 100 , parallel = TRUE )
X：观察值计数矩阵。
V：样本协变量的向量。
(系统自动生成,下载前可以参看下载内容)
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