文件名称:
nf-rnaseq-bacteria:Nextflow管道，用于从NCBI SRA下载和处理微生物RNA序列数据-源码
开发工具:
文件大小: 16kb
下载次数: 0
上传时间: 2021-03-05
详细说明：模数流
Nextflow管道，用于从NCBI SRA下载和处理微生物RNA序列数据
设置
安装
检查的Java 8或更高版本安装使用： java -version
将nextflow下载到当前目录： curl -s https://get.nextflow.io | bash curl -s https://get.nextflow.io | bash
通过运行以下./nextflow run hello测试安装： ./nextflow run hello
安装
为您的数据集准备元数据文件。 使用来获取指定生物的所有元数据。 要附加本地数据，您可以向tsv文件中添加新行，并填写以下各列：
Experiment ：对于公共数据，这是您的SRX ID。 对于本地数据，应使用标准化的ID命名数据（例如ecoli_0001）
LibraryLayout ：要么成对或非单
Platfo
(系统自动生成,下载前可以参看下载内容)
下载文件列表
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