文件名称:
ChromSCape:ChromSCape(单细胞染色质景观分析)-源码
开发工具:
文件大小: 3mb
下载次数: 0
上传时间: 2021-03-04
详细说明:ChromSCape:使用Shiny App分析单细胞表观基因组数据集
什么是ChromSCape?
ChromSCape-用于单细胞的染色质蛋白谱分析-是易于使用的,易于使用的Shiny应用程序,用于分析从对齐数据到差异数据的单细胞表观基因组数据集(scChIP-seq,scATAC-seq,scCUT&Tag等)。分析和基因组富集分析。 它具有高度的交互性,使用户可以保存他们的分析,并涵盖了广泛的分析步骤:质控,预处理,过滤,批处理校正,降维,虚拟化,聚类,差异分析和基因组分析。
启动ChromSCape
ChromSCape需要R版本4.02 。 要安装ChromSCape ,请打开R或Rstudio并运行以下命令:
if (!requireNamespace("BiocManager", quietly = TRUE))
install.packages("BiocM
(系统自动生成,下载前可以参看下载内容)
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