文件名称:
clinker:基因簇比较图生成器-源码
开发工具:
文件大小: 2mb
下载次数: 0
上传时间: 2021-03-04
详细说明：熟料
基因簇比较图生成器
它是什么？
熟料是用于轻松生成出版物质量的基因簇比较图的管道。
给定一组GenBank文件，clinker将自动提取蛋白质翻译，在每个簇中的序列之间进行全局比对，根据簇的相似性确定最佳的显示顺序，并生成可进行广泛调整的交互式可视化（使用 ）。被导出为SVG文件。
安装
熟料可以通过pip直接安装：
pip install clinker
通过从GitHub克隆源代码：
git clone https://github.com/gamcil/clinker.git
cd clinker
pip install .
或者，通过conda：
conda create -n clinker -c conda-forge -c bioconda clinker-py
conda activate clinker
引文
如果您发现熟料有用，请引用：
clink
(系统自动生成,下载前可以参看下载内容)
下载文件列表
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