文件名称:
通过ANOVA特征选择和分析鉴定噬菌体病毒粒子蛋白
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上传时间: 2021-03-04
详细说明：噬菌体病毒粒子蛋白在宿主细菌细胞的命运中起着极其重要的作用。 准确鉴定噬菌体病毒粒子蛋白对于理解其功能和阐明细菌细胞的裂解机制非常重要。 在这项研究中，开发了一种新的基于序列的方法来鉴定噬菌体病毒体蛋白。 在新方法中，蛋白质序列最初是由g-gap二肽组合物配制的。 随后，使用带有增量特征选择（IFS）的方差分析（ANOVA）来搜索最佳特征集。 观察到，在折刀交叉验证中，包括160个优化特征的最佳特征集可产生85.02％的最大精度。 通过特征分析，我们发现两个氨基酸之间有一个缺口的相关性比其他相关性对噬菌体病毒粒子蛋白的预测更重要，并且一些1-gap二肽很重要，并且主要对病毒粒子蛋白的预测有贡献。 该分析将提供对噬菌体病毒体蛋白功能的新颖见解。 根据提出的方法，建立了一个在线Web服务器PVPred，可以从网站（http://lin.uestc.edu.cn/server/PVPred）免费访问。 我们相信，PVPred将成为研究噬菌体病毒粒子蛋白并指导相关实验验证的有力工具。
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