文件名称:
SNIPar：父母基因型的孟德尔插补，基于家庭的GWAS和多基因评分分析-源码
开发工具:
文件大小: 11mb
下载次数: 0
上传时间: 2021-03-04
详细说明：斯尼帕尔
SNIPar（父母的单核苷酸插补）是一个python库，用于从核心家庭中观察到的基因型中估算缺失的父母基因型，并进行基于家庭的全基因组关联和多基因评分分析。
主要特点：
给定一个核心家庭中观察到的基因型，估算缺失的父母基因型（impute_runner.py）。
使用观察到的和估算的父母基因型（fGWAS.py）执行基于家庭的GWAS。
使用观察/估算的父母基因型从SNP权重计算先证者，兄弟姐妹和父母的多基因得分，并进行基于家庭的多基因得分分析（fPGS.py脚本）。
文献资料
建议完成以下教程： :
并阅读指南： :
有关模块和脚本的文档，请访问： :
软件包安装说明
SNIPar具有以下依赖项：
的Python 3.7
包装方式：
h5py
bgen阅读器
麻木
科学的
pysnp工具
大熊猫
网络
赛顿
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