文件名称:
bvcn-binder-lesson1-源码
开发工具:
文件大小: 3mb
下载次数: 0
上传时间: 2021-03-03
详细说明:活页夹
最初是从分叉的。 感谢出色的团队!
:)
演练(具有两个同源序列的种间示例)
输入第一个目录
cd interspecies_example//
对齐FASTA氨基酸文件
muscle -in MNBX01000583.1_4.faa -out MNBX01000583.1_4.fa
根据肽的比对和核苷酸序列进行密码子比对
pal2nal.pl MNBX01000583.1_4.fa MNBX01000583.1_4.ffn -output fasta > MNBX01000583.1_4.codonalign.fa
检查codeml.ctl文件中是否有正确的输入/输出文件
less codeml.ctl
运行代码
codeml codeml.ctl
演练(具有来自一个基因组的三个基因旁系同源物的种内示例)
输入第二个目录
cd intraspecies_example/
对
(系统自动生成,下载前可以参看下载内容)
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